Bestyrelsessekretariatet udøver sekretariatsfunktion for Naalakkersuisut vedrørende ejerskabet af de selvstyreejede aktieselskaber, bidrager til at sikre høj kvalitet i bestyrelserne, og tilser, at Naalakkersuisuts politikker bliver implementeret i de selvstyreejede aktieselskaber.

Sekretariatet er ansvarligt for at føre tilsyn med aktieselskabernes økonomiske udvikling og samfundsmæssige forpligtelser, og varetager derudover tværgående samarbejdsprojekter mellem Naalakkersuisuts øvrige departementer og de selvstyreejede aktieselskaber.